Después de algún tiempo él había perdido todas las esperanzas de recuperar su cuerpo físico. Pero algo ocurrió, un servidor suyo, Peter Pettigrew (más conocido como Colagusano) apareció en busca de su amo. Es entonces cuando Voldemort recupera fuerzas y se ingenia un plan para recuperar su cuerpo. Pettigrew usa el veneno de Nagini y la sangre de unicornio para darle a su amo un cuerpo rudimentario; el cual le daba su característica apariencia aunque del tamaño de un bebé necesitando siempre la ayuda de Colagusano aunque sus poderes aún estaban débiles. Posteriormente utiliza un conjuro llamado Hueso (usa uno de su padre), Carne (de su sirviente Colagusano) y Sangre (de un enemigo). Utiliza la sangre de Harry, pensando que de esa forma al recuperar su cuerpo tendría también la protección de la madre de Harry), y sirviéndose de Harry Potter al finalizar el torneo de los tres magos. Harry, por medio de Barty Crouch hijo (que es un mortífago), quien por medio de la poción multijugos había tomado la imagen de Ojoloco Moody, es engañado para caer en manos de Voldemort. Harry y Voldemort se enfrentan en un duelo que termina gracias a un efecto de sus varitas mágicas llamado Priori Incantatem, que provoca que las dos varitas se conecten, haciendo que la varita de Voldemort comience a escupir los hechizos que había realizado y que la varita de Harry absorbiera parte de su poder, esto se debe a que ambas varitas son hermanas, en su interior tienen las únicas dos plumas del mismo fénix.

Durante el quinto libro, el Ministerio de Magia niega rotundamente el regreso de Voldemort y los únicos que saben de su regreso son Harry, Dumbledore, los amigos de Harry, la Orden del Fénix y los mortífagos. Tras un intento fallido de hacerse con el registro de la profecía de Harry que se guardaba en el Departamento de Misterios, tiene un enfrentamiento con Albus Dumbledore tras el que finalmente huye. Descubre la conexión que existe entre su mente y la de Harry, pero decide no seguir usándola en su provecho cuando descubre que sus intrusiones en la mente de Harry le causan un terrible daño debido a la proximidad al alma de Harry.

En el sexto libro de la saga, se descubre que lord Voldemort sobrevivió al encuentro con Harry Potter, cuando le rebotó su propia maldición, gracias a que había dividido su alma en seis fragmentos almacenados en unos objetos conocidos como Horrocruxes, que deben ser destruidos para que pueda morir totalmente.En el último libro se revela que Harry Potter es el séptimo Horrocrux, el cual no había sido planeado por lord Voldemort.

En el último Libro, la guerra continúa, Voldemort asesina a Ojoloco Moody y mediante el asesinato de Rufus Scrimgeour (ministro de magia) pone a un ministro títere, Pius Ticknesse, a quien controla mediante la maldición Imperius controlando así el Ministerio de Magia. Los demás mortifagos también matan a Fred, Dobby, Lupin, Tonks y Colin Creevey.

Voldemort, en los últimos capítulos, busca la varita más poderosa que existe, la Varita de Saúco (una de las Reliquias de la Muerte), para así poder destruir a Harry Potter de una vez por todas. Dicha varita, estaba en posesión de Albus Dumbledore, quien la había conseguido del entonces poderoso mago tenebroso Gellert Grindewald en un enfrentamiento que tuvieron en el año 1945. Así que profanando la tumba de Albus Dumbledore, Voldemort obtiene la varita. Sin embargo, al no ser el dueño legítimo de la varita esta no actuó como él esperaba, no incrementó sus poderes ni le dio las habilidades que él deseaba, por lo tanto decide asesinar a Severus Snape (ya que Voldemort creyó erróneamente que el dueño legítimo de la varita era Snape, dado que este asesino a Dumbledore) pero el dueño real resultaba ser Draco Malfoy, ya que fue él quien desarmó a Dumbledore aquella noche en la torre de astronomia, mucho antes de que Snape lo matara y luego Harry desarmó a Malfoy quitándole su varita original (cuando fue acorralado en la mansión de los Malfoy), aún sin ser la Varita de Sauco, por lo que su lealtad había cambiado a Harry Potter respectivamente. Cuando Voldemort intenta asesinar a Harry con la Varita de Saúco, siendo este último su dueño legítimo; la varita se niega a atacar a su dueño (Harry), así que la maldición lanzada por Voldemort rebota y este muere, dado que antes todos los fragmentos de su alma (Horrocruxes) ya habían sido destruidos.