En diciembre de 2002, Daniel Radcliffe recibió una invitación para participar como invitado en la obra The Play What I Wrote, que se llevó a cabo en un teatro del distrito West End y que fue dirigida por Kenneth Branagh.²²

En 28 de julio de 2006,⁴⁰ bajo fuertes rumores, la publicista de Radcliffe confirmó la participación del actor en la obra de teatro Equus de Peter Shaffer; su personaje sería Alan Stang, un chico que acaba en un psiquiátrico después de herir a seis caballos.⁴¹ La pieza, un oscuro drama psicológico sobre la pasión y el poder castrador que la sociedad ejerce sobre un individuo en desarrollo, había causado algo de revuelo en su estreno de 1973 por su temática y sus escenas impactantes. Según algunos tabloides ingleses, la elección de este papel causó numerosas críticas de los padres de los seguidores de Harry Potter, en especial cuando se hicieron públicas las primeras fotografías promocionales de la obra en las que Daniel aparecía semidesnudo con la actriz Joanna Christie;^42 43 además, otras exigencias del libreto como el tener que fumar, insultar y hacer un desnudo frontal también espolearon las opiniones negativas. No obstante, tanto la publicista de Radcliffe como el actor declararon que la elección del papel no fue hecha para alejarse del personaje Harry Potter sino para expandir la carrera del actor.^43 42 El intérprete hizo la siguiente declaración respecto de su nuevo papel:

Esto es un sueño hecho realidad. Alan Strang es un personaje increíblemente complejo y oscuro, y me siento honrado de que se me haya encargado interpretarlo, además de trabajar junto a Thea Sharrock y Richard Griffiths.⁴⁴

La obra se estrenó el 27 de febrero de 2007. La misma terminó recaudando 2 millones de libras y debió extender sus funciones dos semanas más de lo acordado, hasta el 9 de junio del 2007.⁴¹ El actor recibió numerosas críticas positivas por este trabajo y,^41 45 46 a pesar de rumores difundidos por el tabloide Daily Mail sobre el descontento de Warner Bros. –productora de las películas de Harry Potter–,⁴⁷ Radcliffe no fue desvinculado del papel que lo hizo famoso, recibiendo el apoyo de la productora en este emprendimiento.⁴⁶

Debido al éxito de la puesta en Londres, la producción decidió trasladar la obra a Broadway, Nueva York; la misma que se estrenó el 25 de septiembre de 2008.^41 48 Radcliffe declaró sentirse nervioso por repetir el papel en Broadway, ya que en su opinión el público neoyorquino es más perspicaz que el londinense.⁴⁹ La obra, que estuvo en cartel hasta el 8 de febrero de 2009,⁵⁰ recibió una buena acogida por parte de la crítica norteamericana destacando las interpretaciones deRichard Griffiths y Radcliffe.^{7 51 52 53}

Tiempo después, el actor manifestó sus deseos de volver a trabajar en Broadway y declaró que estaba tomando clases de canto para una posible obra musical.⁵⁴ En octubre de 2009 se confirmó que Radcliffe aparecería en la obra How to Succeed in Business Without Really Trying, interpretando a un limpiaventanas que acaba dirigiendo una importante empresa.⁸

En el año 2013. Radcliffe volvió al teatro con la comedia obscura "The Cripple of Inishmaan" de "Martin McDonagh", interpretando al personaje "Cripple" Billy Claven.